More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4026 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  63.11 
 
 		 724 aa  900    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  97.62 
 
 		 756 aa  1467    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 755 aa  1527    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  56.92 
 
 		 719 aa  800    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  49.2 
 
 		 771 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  65.62 
 
 		 705 aa  922    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  63.61 
 
 		 724 aa  916    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  41.6 
 
 		 727 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  42.79 
 
 		 755 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 		 735 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  39.5 
 
 		 707 aa  446  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 693 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 709 aa  337  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 757 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 719 aa  326  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 706 aa  324  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 706 aa  324  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  36.11 
 
 		 695 aa  323  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 707 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 792 aa  318  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 770 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 710 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 710 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 		 694 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  34.94 
 
 		 715 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 708 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 732 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 745 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 726 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 732 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 821 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 766 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 726 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 726 aa  243  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  29.65 
 
 		 772 aa  238  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 747 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  27.89 
 
 		 753 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 748 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  29.25 
 
 		 748 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 748 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 689 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 712 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 689 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 656 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 749 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 734 aa  231  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 747 aa  230  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 747 aa  230  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 860 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 748 aa  229  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 837 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 747 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 817 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.65 
 
 		 711 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 769 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 759 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 759 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 700 aa  225  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 740 aa  225  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  29.76 
 
 		 680 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 736 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 738 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 753 aa  221  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  28.47 
 
 		 765 aa  221  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 734 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 747 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 751 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 753 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 747 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 712 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 747 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 710 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 689 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 736 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 714 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 711 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 741 aa  213  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 698 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 815 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  27.8 
 
 		 760 aa  212  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  27.78 
 
 		 760 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  27.78 
 
 		 760 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 760 aa  210  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  27.54 
 
 		 760 aa  210  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  27.54 
 
 		 760 aa  210  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 741 aa  210  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  27.67 
 
 		 760 aa  210  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  27.8 
 
 		 760 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.98 
 
 		 709 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 733 aa  209  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 850 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 734 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 733 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 826 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>