More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4025 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  97.65 
 
 
213 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  92.49 
 
 
213 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.53 
 
 
213 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  61.03 
 
 
211 aa  254  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  58.69 
 
 
208 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  57.75 
 
 
208 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  57.92 
 
 
207 aa  242  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.49 
 
 
206 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.64 
 
 
205 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.46 
 
 
210 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  57.95 
 
 
210 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.55 
 
 
211 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.68 
 
 
227 aa  204  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.86 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  45.02 
 
 
209 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 
200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  38.12 
 
 
201 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 
211 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  41.09 
 
 
211 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  40.82 
 
 
214 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  37.5 
 
 
214 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.53 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  39.61 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  38.66 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  37.5 
 
 
215 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.27 
 
 
211 aa  131  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  36.19 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.95 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
213 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  37.19 
 
 
198 aa  121  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  38.16 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  36.36 
 
 
213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  36.18 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.87 
 
 
207 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
203 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 
204 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.16 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 
201 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  32.16 
 
 
204 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.16 
 
 
204 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  30.46 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.15 
 
 
202 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  32.49 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.55 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.57 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 
204 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  33.83 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.33 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  30.41 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  32.68 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  29.44 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  30 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6902  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.05 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.86 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  27.86 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  32.09 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  35.26 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  35.26 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  29.81 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  32.12 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.68 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  31.88 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  29.26 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  31.34 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.34 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  30.88 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  31.02 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  31.44 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.26 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  31.86 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  27.54 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.42 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.42 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.6 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.61 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.74 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  31.84 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.51 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  34.32 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>