228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3969 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  96.91 
 
 		 259 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  79.01 
 
 		 255 aa  361  6e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  65.25 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  47.66 
 
 		 267 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 303 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 		 229 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  41.47 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 242 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  43.91 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 229 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  38.71 
 
 		 245 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  44.35 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  38.91 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  36.68 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  39.92 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  38.96 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  40.83 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  38.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  38.91 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  39.3 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 248 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  41.52 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  38.33 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  37.92 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 230 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  35.23 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  41.42 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  35.35 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 662 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  37 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  35.78 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  33.77 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>