75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3965 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  98.4 
 
 		 313 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  92.19 
 
 		 320 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  83.81 
 
 		 315 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3003  hypothetical protein  50.78 
 
 		 154 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  29.51 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  41.94 
 
 		 147 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  41.94 
 
 		 147 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  27.39 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  40.32 
 
 		 147 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  34.72 
 
 		 148 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  35.46 
 
 		 146 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  37.84 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  39.73 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  36.89 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  34.81 
 
 		 148 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  37.61 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  34.72 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  32.52 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  37.59 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  34.72 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  32.59 
 
 		 148 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  22.41 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  35.17 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  35.86 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  36.75 
 
 		 170 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  34.04 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  33.58 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  28.38 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  34.04 
 
 		 147 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  34.04 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  34.81 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  34.04 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  34.96 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  32.85 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  31.2 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  27.64 
 
 		 147 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  22.4 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  34.15 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  31.94 
 
 		 149 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  25.74 
 
 		 151 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  32.74 
 
 		 146 aa  52.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  26.83 
 
 		 149 aa  52.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  32.06 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  36.52 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  33.81 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  33.66 
 
 		 172 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  27.69 
 
 		 147 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  32.95 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  35.23 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  33.04 
 
 		 172 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  34.68 
 
 		 172 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  27.64 
 
 		 148 aa  46.2  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  32.06 
 
 		 146 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  33.87 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.42 
 
 		 163 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  21.66 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  31.9 
 
 		 147 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  34.71 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  34.94 
 
 		 148 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  21.66 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30.4 
 
 		 148 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  27.08 
 
 		 144 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  30.17 
 
 		 164 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  29.33 
 
 		 176 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  28.06 
 
 		 183 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>