23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3925 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  99.4 
 
 		 334 aa  666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  60.61 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  53.01 
 
 		 359 aa  349  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  54.68 
 
 		 332 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  54.08 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  24.07 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  24.32 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  26.58 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  23.88 
 
 		 354 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.4 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  26.03 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  24.38 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  22.43 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  25 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  25.09 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  25 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  25.34 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.44 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  24.15 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  23.58 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  25.39 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  24.38 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>