More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3845 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
247 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  97.98 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  93.12 
 
 
247 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  50.79 
 
 
258 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  49.21 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  45.63 
 
 
259 aa  221  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.42 
 
 
251 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  42.97 
 
 
256 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.87 
 
 
253 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.83 
 
 
233 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.02 
 
 
262 aa  198  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.02 
 
 
262 aa  198  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.41 
 
 
256 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  41.92 
 
 
262 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.29 
 
 
249 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.55 
 
 
256 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  40.66 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  35.33 
 
 
315 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  35.33 
 
 
315 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
318 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  36.48 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  35.89 
 
 
249 aa  141  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  35.8 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  38.21 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  31.87 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  39.71 
 
 
495 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.52 
 
 
240 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  34.05 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  34.02 
 
 
255 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.24 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  31.97 
 
 
262 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.68 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  30.95 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.6 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  43.64 
 
 
319 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.62 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  32.94 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.43 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  32.26 
 
 
263 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  33.47 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.41 
 
 
239 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.91 
 
 
517 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  32.93 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  31.56 
 
 
263 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  32.05 
 
 
255 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.74 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.74 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  38.96 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  34.8 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  32.64 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  32.05 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  40.26 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.98 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.74 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  31.02 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.06 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.06 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.06 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.06 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.06 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  32.16 
 
 
215 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.87 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.47 
 
 
263 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.47 
 
 
263 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  34.83 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  39.61 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.92 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  34.83 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  33.49 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.82 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  34.01 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  32.26 
 
 
234 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  38.51 
 
 
227 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28 
 
 
328 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.31 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.43 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.13 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.88 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.49 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.09 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  32.43 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.03 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.7 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.7 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.65 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.61 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.72 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  36.09 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.61 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.16 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.16 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  28.37 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.93 
 
 
301 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.4 
 
 
266 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>