More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3842 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  98.28 
 
 		 349 aa  669    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  100 
 
 		 349 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  91.74 
 
 		 345 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  66.77 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  65.34 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  58.52 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  50.15 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  49.85 
 
 		 350 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  47.35 
 
 		 353 aa  281  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  48.73 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  48.59 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  37.27 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  37.84 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  36.28 
 
 		 366 aa  232  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  42.4 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  35.85 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  34.78 
 
 		 362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  37.35 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  35.9 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  37.96 
 
 		 340 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  36.78 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  34.7 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.71 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  31.31 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  31 
 
 		 365 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  39.27 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.31 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  31 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  35.05 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  34.23 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  30.35 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  34.48 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  33.64 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  34.4 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  30.75 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  34.58 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.55 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  35.55 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  31.8 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.8 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  30.52 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  28.71 
 
 		 331 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  32.18 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  31.61 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.43 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  29.23 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.79 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  29.51 
 
 		 350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  29.51 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  29.51 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  31.32 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  32.13 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  28.98 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.47 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  31.76 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.63 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  30.18 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  29.19 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  29.14 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  30.46 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.22 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.73 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.67 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  31.76 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  29.06 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  28.27 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  24.77 
 
 		 397 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  29.18 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 372 aa  93.2  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.46 
 
 		 353 aa  92.8  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 390 aa  92.4  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  29.28 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.06 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  24.17 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>