More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3822 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 308 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  95.68 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  38.77 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 		 248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.58 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  34.7 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  33.48 
 
 		 226 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 246 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0172  hypothetical protein  72.88 
 
 		 76 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 287 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 287 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 		 265 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 361 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 267 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 272 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.91 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  31.42 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.27 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  31.83 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.13 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.37 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  27.6 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  26.21 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>