More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3748 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  99.52 
 
 
419 aa  870    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  90.45 
 
 
419 aa  788    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  96.66 
 
 
419 aa  850    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  90.69 
 
 
419 aa  813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
419 aa  873    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.15 
 
 
413 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  63.41 
 
 
413 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  63.66 
 
 
413 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  63.41 
 
 
422 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  63.41 
 
 
422 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  63.66 
 
 
422 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  63.66 
 
 
422 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  63.41 
 
 
422 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  63.17 
 
 
413 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.24 
 
 
423 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.99 
 
 
413 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.08 
 
 
437 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  61.26 
 
 
413 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  61.02 
 
 
413 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.02 
 
 
413 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.65 
 
 
426 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.02 
 
 
413 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.77 
 
 
413 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  60.54 
 
 
437 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.77 
 
 
413 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.99 
 
 
421 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  61.59 
 
 
414 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.68 
 
 
417 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.68 
 
 
417 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  51.72 
 
 
420 aa  441  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6857  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.01 
 
 
418 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.36 
 
 
434 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.09 
 
 
434 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.47 
 
 
414 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.26 
 
 
412 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.23 
 
 
414 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.23 
 
 
410 aa  359  6e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  44.33 
 
 
405 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  44.33 
 
 
405 aa  349  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.04 
 
 
415 aa  348  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  42.93 
 
 
410 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0981  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  45.84 
 
 
429 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1189  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.88 
 
 
450 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  42.2 
 
 
432 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.73 
 
 
423 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3219  Rieske (2Fe-2S) region  44.42 
 
 
408 aa  342  7e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201195  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  41.95 
 
 
429 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.84 
 
 
412 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  43.1 
 
 
410 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  41.46 
 
 
429 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  42.75 
 
 
445 aa  338  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.33 
 
 
424 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.71 
 
 
430 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.46 
 
 
430 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.46 
 
 
430 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  40.59 
 
 
430 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.46 
 
 
430 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.75 
 
 
427 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  40.82 
 
 
416 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41 
 
 
414 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.17 
 
 
413 aa  300  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.64 
 
 
418 aa  289  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.09 
 
 
423 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.51 
 
 
408 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  30.27 
 
 
380 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  29.7 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  29.19 
 
 
376 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.99 
 
 
385 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  28.5 
 
 
385 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
385 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.71 
 
 
403 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.3 
 
 
369 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.05 
 
 
373 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  27.14 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
374 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
374 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  32.22 
 
 
374 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.22 
 
 
374 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
374 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  32.22 
 
 
374 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  32.22 
 
 
374 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
374 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  35.15 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.8 
 
 
374 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 
429 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.63 
 
 
423 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  36.27 
 
 
414 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.612089  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0797  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.68 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.18 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.61 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.85 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
427 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3776  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  32.06 
 
 
429 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.31 
 
 
423 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>