136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3712 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
411 aa  822    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  31.43 
 
 
723 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  32.45 
 
 
279 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  30.73 
 
 
1673 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  29.96 
 
 
278 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0515  FkbM family methyltransferase  29.47 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  35.58 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  33.16 
 
 
295 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  31.87 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  32.89 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  28.73 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  33.67 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  32.3 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  31.61 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  28.4 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  25.11 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  31.95 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  30.63 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  31.28 
 
 
283 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  30.22 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  26.46 
 
 
625 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  30.65 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  32.86 
 
 
283 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  30.05 
 
 
272 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  30.85 
 
 
274 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  30.23 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  30.23 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  30.05 
 
 
326 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  30.05 
 
 
313 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  31.61 
 
 
454 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  29.79 
 
 
261 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  27.93 
 
 
280 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  29.73 
 
 
283 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  27.39 
 
 
264 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  28.12 
 
 
303 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  27.6 
 
 
239 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  30.61 
 
 
739 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  27.95 
 
 
321 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  30.61 
 
 
741 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
265 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  30.1 
 
 
738 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  27.81 
 
 
265 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  28.35 
 
 
297 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  29.49 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  24.62 
 
 
287 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  24.62 
 
 
287 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  28.81 
 
 
321 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  28.21 
 
 
254 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  28.19 
 
 
234 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  29.35 
 
 
268 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  30.41 
 
 
285 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  30.18 
 
 
313 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  29.02 
 
 
282 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  22.76 
 
 
488 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  26.73 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  28.5 
 
 
259 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  24.38 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  25.95 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  27.56 
 
 
266 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  30.5 
 
 
237 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  26.21 
 
 
657 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  30.73 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  29.74 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  24.04 
 
 
264 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  24.04 
 
 
264 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  25.27 
 
 
446 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  30.82 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  26.11 
 
 
365 aa  53.1  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  25.27 
 
 
451 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  25.27 
 
 
446 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  30.77 
 
 
287 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  26.71 
 
 
258 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  23.33 
 
 
657 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  23.33 
 
 
657 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1251  FkbM family methyltransferase  22.95 
 
 
262 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000622553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
257 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  24.73 
 
 
451 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  24.73 
 
 
451 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2378  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  46.77 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  25.51 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  24.05 
 
 
657 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  26.7 
 
 
275 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  26.74 
 
 
921 aa  51.2  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  28.65 
 
 
319 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  42.19 
 
 
297 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  27.98 
 
 
279 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2844  methyltransferase FkbM  28.73 
 
 
312 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1435  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
267 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4271  methyltransferase FkbM family  25.12 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  30.41 
 
 
262 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  29.19 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1297  methyltransferase FkbM  25.93 
 
 
234 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  31.61 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  26.97 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  32.08 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  29.08 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.82 
 
 
792 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>