More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3639 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  98.65 
 
 
296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  96.18 
 
 
291 aa  548  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  81.98 
 
 
283 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  82.52 
 
 
285 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  80.71 
 
 
292 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  70.86 
 
 
288 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  68.57 
 
 
287 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  64.75 
 
 
275 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  64.39 
 
 
275 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  65.71 
 
 
286 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  68.21 
 
 
287 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  62.86 
 
 
287 aa  348  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  65.47 
 
 
286 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  66.55 
 
 
287 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  62.95 
 
 
275 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  65 
 
 
274 aa  341  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  64.81 
 
 
288 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  62.24 
 
 
297 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  63.67 
 
 
287 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  61.7 
 
 
275 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  64.41 
 
 
276 aa  321  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  64.41 
 
 
276 aa  321  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  63.38 
 
 
278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  62.45 
 
 
281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  57.04 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  60.78 
 
 
282 aa  302  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
278 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  59.07 
 
 
278 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  58.42 
 
 
278 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  58.25 
 
 
305 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  56.07 
 
 
276 aa  293  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  56.69 
 
 
280 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  59.19 
 
 
288 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  57.04 
 
 
276 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  57.97 
 
 
273 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  56.16 
 
 
271 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  49.83 
 
 
289 aa  236  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  52.69 
 
 
288 aa  234  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  54.29 
 
 
272 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  50.9 
 
 
275 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  36.03 
 
 
286 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 
262 aa  178  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  32.14 
 
 
277 aa  178  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.5 
 
 
279 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  33.69 
 
 
284 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  36.53 
 
 
299 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
276 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
268 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 
268 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  42.12 
 
 
276 aa  148  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 
276 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  40.78 
 
 
284 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  32.87 
 
 
297 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  35.46 
 
 
262 aa  144  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
257 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
269 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  41.22 
 
 
281 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  37.72 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  37.72 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  32.75 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  32.52 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  38.66 
 
 
272 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  31.21 
 
 
301 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  35.34 
 
 
267 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  34.7 
 
 
267 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
266 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 
268 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  30.58 
 
 
291 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  39.42 
 
 
272 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  32.99 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  32.32 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
272 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
267 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  34.59 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  34.33 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  38.93 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  32.99 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  33.89 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  34.18 
 
 
292 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  34.33 
 
 
266 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  34.91 
 
 
262 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>