104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3609 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  99.32 
 
 
147 aa  268  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  93.88 
 
 
147 aa  221  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  54.42 
 
 
147 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  54.42 
 
 
148 aa  143  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  54.79 
 
 
148 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  52.38 
 
 
147 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  57.14 
 
 
147 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  48.98 
 
 
177 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  42.54 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  41.79 
 
 
147 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  41.04 
 
 
147 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  41.1 
 
 
148 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  37.59 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  43.41 
 
 
147 aa  93.2  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  39.73 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  36.49 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  37.59 
 
 
184 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  40.56 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  39.26 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  40.8 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  34.06 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  35.66 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  29.37 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  44.36 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  36.96 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  34.06 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  34.75 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  38.4 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  35.34 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  35.46 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  38.4 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  35.04 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  36.69 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  36.69 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  33.57 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  36.8 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  34.97 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  34.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  33.81 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.69 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  31.21 
 
 
317 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  30.99 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  34.72 
 
 
320 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  32.86 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  34.65 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  34.72 
 
 
313 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  34.72 
 
 
313 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  37.14 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  36.43 
 
 
167 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  31.11 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  37.78 
 
 
315 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  40 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  33.07 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.22 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.43 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  32.2 
 
 
153 aa  57.8  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  34.51 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  36.8 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  34.83 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  35.14 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  38.82 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  34.09 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  33.86 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  30.53 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  32.59 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  32.33 
 
 
148 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  32.09 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  28.06 
 
 
297 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  27.54 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  32.8 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  34.56 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  27.66 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  29.71 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  28.87 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  28.87 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  27.14 
 
 
307 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  30.47 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  25.69 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  25.69 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  31.91 
 
 
146 aa  43.5  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  36 
 
 
146 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  30.49 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  29.32 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  32.84 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  36.67 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  25.84 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  29.32 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  29.01 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  29.32 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  29.32 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  28.92 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  28.92 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  28.92 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>