63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3411 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  100 
 
 
460 aa  895  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  100 
 
 
460 aa  895  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  91.11 
 
 
460 aa  784  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  56.29 
 
 
468 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  39.24 
 
 
445 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  40.13 
 
 
442 aa  283  4e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  41.2 
 
 
465 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  40.26 
 
 
474 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  43.08 
 
 
462 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  35.37 
 
 
455 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.85 
 
 
453 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  38.5 
 
 
466 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.23 
 
 
481 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  39.57 
 
 
470 aa  233  7e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  37.28 
 
 
469 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  37.05 
 
 
469 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
445 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  38.22 
 
 
466 aa  226  5e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  38.22 
 
 
466 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  38.22 
 
 
466 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  38.22 
 
 
466 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  38.22 
 
 
466 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  38.22 
 
 
466 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  35.31 
 
 
467 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  38.5 
 
 
471 aa  225  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  36.97 
 
 
470 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  35.59 
 
 
473 aa  217  3e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  34.79 
 
 
467 aa  217  3e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  36.62 
 
 
455 aa  215  1e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  36.04 
 
 
474 aa  214  2e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  36.04 
 
 
444 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  34.65 
 
 
471 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  36.3 
 
 
473 aa  204  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.39 
 
 
475 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
485 aa  201  2e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  36 
 
 
464 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  33.56 
 
 
454 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.82 
 
 
455 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
478 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  32.24 
 
 
456 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  32.75 
 
 
453 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  31.69 
 
 
479 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  39.39 
 
 
1751 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.21 
 
 
443 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.34 
 
 
482 aa  174  3e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
480 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  31.51 
 
 
478 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  32.14 
 
 
499 aa  164  4e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.63 
 
 
883 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
523 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  26.79 
 
 
468 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  25.83 
 
 
466 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.11 
 
 
468 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  27.49 
 
 
458 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  58.51 
 
 
239 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  21.93 
 
 
506 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  24.17 
 
 
533 aa  65.1  2e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  27.59 
 
 
490 aa  64.7  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  70.83 
 
 
61 aa  62.8  1e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  28.64 
 
 
477 aa  58.9  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  25.72 
 
 
633 aa  55.5  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  27.32 
 
 
507 aa  53.9  6e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.76 
 
 
608 aa  52  3e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>