254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3395 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 153 aa  304  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  96.08 
 
 		 153 aa  296  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  88.89 
 
 		 153 aa  278  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  76.98 
 
 		 145 aa  224  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  75 
 
 		 145 aa  216  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 		 147 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 		 147 aa  196  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  64.63 
 
 		 203 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  66.19 
 
 		 181 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  66.19 
 
 		 181 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  66.19 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  66.19 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  66.19 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  63.31 
 
 		 149 aa  187  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  66.19 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  63.24 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  66.42 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  62.33 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 		 142 aa  184  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  64.83 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  62.77 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  62.22 
 
 		 149 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  61.43 
 
 		 155 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 		 143 aa  177  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  67.2 
 
 		 153 aa  176  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  54.36 
 
 		 148 aa  173  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  60.87 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  61.59 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  60.45 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  60.14 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  57.24 
 
 		 150 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  60.87 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  58.78 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  71.68 
 
 		 125 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  59.85 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  52.82 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  60.9 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  56.82 
 
 		 136 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  57.14 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  60.45 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  54.41 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  55.73 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  51.43 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  54.96 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  52.31 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  48.23 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  48.48 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  46.81 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  44.9 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  36.03 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.86 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  27.34 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  32.77 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  27.94 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  27.74 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  31.97 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>