179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3375 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  75.06 
 
 
410 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  99.02 
 
 
409 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  95.35 
 
 
409 aa  774    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  88.97 
 
 
409 aa  760    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  83.82 
 
 
409 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  79.22 
 
 
410 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  80.93 
 
 
410 aa  688    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  82.64 
 
 
410 aa  710    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  83.82 
 
 
409 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  80.44 
 
 
412 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  80.44 
 
 
412 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  84.31 
 
 
409 aa  723    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  77.32 
 
 
410 aa  665    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  76.72 
 
 
410 aa  663    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  83.37 
 
 
409 aa  693    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  82.6 
 
 
409 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  79.46 
 
 
410 aa  663    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  80.44 
 
 
412 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  81.66 
 
 
410 aa  702    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  79.17 
 
 
409 aa  683    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  100 
 
 
409 aa  841    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  100 
 
 
409 aa  841    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  70.44 
 
 
411 aa  616  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  68.42 
 
 
406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  68.1 
 
 
408 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  70.53 
 
 
408 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  61.73 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  57.28 
 
 
415 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  56.16 
 
 
414 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  55.86 
 
 
416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  56.11 
 
 
411 aa  463  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  54.35 
 
 
451 aa  458  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  55.67 
 
 
417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  54.68 
 
 
418 aa  441  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  55.05 
 
 
417 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  55.05 
 
 
417 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  53.85 
 
 
417 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  55.05 
 
 
417 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  52.75 
 
 
426 aa  432  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  53.1 
 
 
423 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  53.81 
 
 
418 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  50.97 
 
 
418 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  51.09 
 
 
420 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  47.48 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  54.5 
 
 
206 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  35.48 
 
 
393 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  34.26 
 
 
388 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  31.62 
 
 
459 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.15 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.87 
 
 
322 aa  141  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  29.46 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.35 
 
 
315 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.8 
 
 
319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.8 
 
 
319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  30.36 
 
 
224 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  29.16 
 
 
319 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  26.85 
 
 
314 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  27.4 
 
 
314 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  27.32 
 
 
301 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  26.5 
 
 
312 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  31.66 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  30.62 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  26.23 
 
 
312 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  24.67 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  31.35 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  30.11 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  30.95 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  24.62 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  28.69 
 
 
314 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  29.44 
 
 
481 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.15 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  29.67 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.62 
 
 
359 aa  77  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  25.75 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  27.84 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  26.98 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  26.98 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  27.8 
 
 
485 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  30.09 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  26.98 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  27 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  25.78 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  26.38 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  25.75 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  25.75 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  26.77 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  26.77 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.27 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  30.95 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  28.97 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.03 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  31.36 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  28.9 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  32.55 
 
 
479 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  26.59 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  26.59 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  28.1 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  25.32 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.24 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  30.89 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>