196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3316 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  100 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  99.64 
 
 		 275 aa  534  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  91.67 
 
 		 275 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  67.07 
 
 		 269 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  66.79 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  70.97 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  52.11 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  51.17 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  51.17 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.35 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  41.46 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  41.67 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.72 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  42.16 
 
 		 318 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.16 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  40.2 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  42.42 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  42.36 
 
 		 238 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  34.33 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  33.18 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  32.88 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  35.82 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  32.2 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  32.6 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  37.13 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  34.11 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  34.07 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  32.92 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  30.67 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  32.26 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  34.21 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  32.63 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  39.29 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  31.75 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  35.03 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  33.08 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  30.98 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  30.9 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.59 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  31.32 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  32.48 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  30.57 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  28.95 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.41 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  26.37 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  30.34 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.56 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  30.53 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.79 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  31 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.56 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.77 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  31.94 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  27.01 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.05 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.54 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.46 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  39.39 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  31.87 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  35.96 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  28.93 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  25.97 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  38.94 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.95 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  22.34 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  39.2 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  30.64 
 
 		 198 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  41.03 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  39.2 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  28.75 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  36.29 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  27.57 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  25.26 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  27.59 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  29.63 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  35.78 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  28.8 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  30.7 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  26.8 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  38.4 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  28.42 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.37 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  29.19 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  30.65 
 
 		 202 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  26.26 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  37 
 
 		 195 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  28.44 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  29.26 
 
 		 201 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  29.24 
 
 		 200 aa  52.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  21.29 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  27.72 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  33.05 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  29.63 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  33.64 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  40.18 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  36.8 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>