More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3314 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  374  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  98.51 
 
 
202 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  94.55 
 
 
202 aa  315  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  83.94 
 
 
201 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  65.13 
 
 
203 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60.21 
 
 
201 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.55 
 
 
196 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.95 
 
 
196 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  61.98 
 
 
201 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  66.15 
 
 
198 aa  203  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  61.46 
 
 
201 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.54 
 
 
198 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  80.66 
 
 
199 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.06 
 
 
197 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60.91 
 
 
203 aa  198  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.77 
 
 
206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.7 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.58 
 
 
196 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  62.12 
 
 
203 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  58.67 
 
 
209 aa  185  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  58 
 
 
204 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  55.78 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  57 
 
 
212 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  59.36 
 
 
201 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  59.36 
 
 
201 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  54.63 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3312  protein of unknown function DUF205  75 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  57.07 
 
 
203 aa  165  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  56.15 
 
 
194 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  46.88 
 
 
211 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  46.53 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  63.08 
 
 
202 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  52.04 
 
 
203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  40.96 
 
 
195 aa  151  8e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.14 
 
 
216 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  59.49 
 
 
197 aa  148  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.45 
 
 
215 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  50.53 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  48.07 
 
 
194 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  41.18 
 
 
191 aa  142  4e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.38 
 
 
202 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.39 
 
 
203 aa  140  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  55.03 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  45.96 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  52.15 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  47.59 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.63 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.39 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.33 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2760  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.24 
 
 
210 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  45.21 
 
 
195 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.96 
 
 
203 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  47.83 
 
 
226 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.16 
 
 
212 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  46.04 
 
 
198 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.27 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.77 
 
 
200 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  47.06 
 
 
193 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.94 
 
 
212 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  44.62 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.69 
 
 
198 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.94 
 
 
212 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  46.77 
 
 
193 aa  134  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  45.36 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.12 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.43 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.08 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.48 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  44.79 
 
 
211 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.79 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.69 
 
 
212 aa  131  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  43.63 
 
 
216 aa  131  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.9 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  44.85 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.9 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.9 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.9 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.79 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.9 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.9 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.9 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.9 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3772  protein of unknown function DUF205  49.5 
 
 
211 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  48.88 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  46.5 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.27 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  43.01 
 
 
210 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  46.12 
 
 
213 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  46.96 
 
 
194 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  39.57 
 
 
203 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  39.46 
 
 
196 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.97 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1945  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.46 
 
 
213 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  40 
 
 
196 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2556  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.46 
 
 
213 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477971  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1045  membrane protein  39.79 
 
 
192 aa  122  5e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.88 
 
 
208 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  38.42 
 
 
195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  40.43 
 
 
195 aa  118  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>