More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3306 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  94.63 
 
 		 392 aa  735    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  87.98 
 
 		 392 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 391 aa  792    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  87.72 
 
 		 392 aa  670    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 391 aa  792    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  99.23 
 
 		 391 aa  786    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  76.13 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  74.06 
 
 		 397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  70.44 
 
 		 389 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  69.1 
 
 		 398 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  69.6 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  68.92 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  70.89 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  69.1 
 
 		 398 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  69.54 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  68.75 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  69.64 
 
 		 394 aa  534  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  67.77 
 
 		 389 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  69.92 
 
 		 388 aa  514  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  66.51 
 
 		 421 aa  511  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  67.4 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  66.03 
 
 		 420 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  67.52 
 
 		 395 aa  508  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  66.27 
 
 		 421 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  66.99 
 
 		 426 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  67.16 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  67.77 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  62.62 
 
 		 426 aa  497  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  62.9 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  65.71 
 
 		 426 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 		 388 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  66.24 
 
 		 388 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  63.79 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  62.03 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  56.36 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  57.11 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  55.36 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  54.27 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  55.27 
 
 		 381 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  54.16 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  56.07 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  53.4 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  56.33 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  55.56 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  54.76 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  54.24 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  54.04 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  53.54 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  53.44 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  54.26 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  53.98 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  53.98 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  54.24 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  54.22 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  54.85 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  53.15 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  55.04 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  52.58 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  52.32 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  52.27 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  54.4 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  53.15 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  54.15 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  54.4 
 
 		 383 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  53.15 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  52.9 
 
 		 396 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  54.66 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  54.01 
 
 		 384 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  54.01 
 
 		 384 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  54.66 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  52.97 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  54.15 
 
 		 383 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  54.92 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  54.92 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  53.63 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  54.92 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  54.01 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  54.01 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  53.89 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  53.89 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  54.01 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  54.01 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  53.75 
 
 		 384 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  53.75 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  53.89 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  52.82 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  54.01 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1840  S-adenosylmethionine synthetase  52.62 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>