41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3291 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  459  1e-128  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  98.24 
 
 
227 aa  453  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  83.7 
 
 
225 aa  357  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  64.74 
 
 
241 aa  234  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  49.72 
 
 
203 aa  171  7e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  46.41 
 
 
206 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  39.75 
 
 
178 aa  117  1e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  32 
 
 
227 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  32.69 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  32.16 
 
 
182 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  31.37 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  84.3  1e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  29.82 
 
 
182 aa  81.6  1e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  28.95 
 
 
192 aa  80.9  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  27.37 
 
 
191 aa  79.3  5e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  27.63 
 
 
199 aa  78.6  8e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  29.8 
 
 
169 aa  74.3  1e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  27.33 
 
 
190 aa  67  2e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  30.97 
 
 
176 aa  67  2e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  31.61 
 
 
176 aa  67.4  2e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  31.61 
 
 
176 aa  67.4  2e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  24.84 
 
 
167 aa  63.9  2e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  27.81 
 
 
167 aa  63.5  2e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  26.71 
 
 
169 aa  63.5  3e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  28.29 
 
 
164 aa  62  7e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  29.01 
 
 
173 aa  61.6  9e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  25.83 
 
 
169 aa  61.2  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  26.49 
 
 
167 aa  60.1  3e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  25.83 
 
 
204 aa  58.9  6e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  25.5 
 
 
162 aa  58.2  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  24.83 
 
 
175 aa  58.2  1e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  26.8 
 
 
165 aa  56.2  4e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  27.01 
 
 
177 aa  55.8  5e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  55.8  5e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  24.59 
 
 
167 aa  55.5  7e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  27.92 
 
 
175 aa  55.1  9e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  26.62 
 
 
182 aa  53.1  3e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  23.84 
 
 
178 aa  53.1  4e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  25 
 
 
169 aa  50.4  2e-05  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  26.45 
 
 
168 aa  48.5  9e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  25.87 
 
 
166 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>