More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3246 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
1145 aa  2225    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  47.3 
 
 
1081 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  98.47 
 
 
1110 aa  2111    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  74.34 
 
 
1088 aa  1429    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  59.57 
 
 
1242 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  58.91 
 
 
1199 aa  268  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  30.47 
 
 
978 aa  214  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.29 
 
 
1110 aa  211  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.54 
 
 
1196 aa  197  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  40.73 
 
 
1059 aa  197  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  40.46 
 
 
1086 aa  186  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.29 
 
 
1012 aa  184  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.74 
 
 
1260 aa  180  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.06 
 
 
1263 aa  180  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  39.38 
 
 
1160 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  44.36 
 
 
1003 aa  169  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  28.68 
 
 
913 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  48.66 
 
 
1275 aa  159  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.66 
 
 
884 aa  152  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  45 
 
 
795 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.65 
 
 
1072 aa  124  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  41.61 
 
 
416 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.4 
 
 
789 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.15 
 
 
241 aa  102  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 
831 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.13 
 
 
305 aa  101  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.95 
 
 
997 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.93 
 
 
235 aa  100  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.48 
 
 
684 aa  99.8  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.2 
 
 
373 aa  99.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  40 
 
 
961 aa  99.4  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.64 
 
 
373 aa  97.8  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.65 
 
 
321 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.88 
 
 
246 aa  96.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  39.44 
 
 
185 aa  95.9  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  38.06 
 
 
1037 aa  95.5  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.64 
 
 
393 aa  95.5  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.5 
 
 
1402 aa  93.6  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.44 
 
 
557 aa  93.2  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 
359 aa  93.6  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34 
 
 
318 aa  93.6  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  35.1 
 
 
1877 aa  92.8  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
303 aa  92  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
1032 aa  90.9  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  42.86 
 
 
490 aa  91.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  37.89 
 
 
1910 aa  90.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.6 
 
 
293 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  45.26 
 
 
489 aa  90.9  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 
1430 aa  90.1  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  39.39 
 
 
256 aa  89.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  41.53 
 
 
232 aa  89.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
448 aa  89  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  89  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.76 
 
 
490 aa  88.6  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.93 
 
 
331 aa  88.2  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.19 
 
 
358 aa  87.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.95 
 
 
267 aa  86.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.72 
 
 
376 aa  86.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  32.28 
 
 
344 aa  87  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  35.77 
 
 
264 aa  85.9  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.75 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.69 
 
 
528 aa  85.1  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.9 
 
 
838 aa  85.1  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.98 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.08 
 
 
1493 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.24 
 
 
329 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  38.57 
 
 
464 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.12 
 
 
278 aa  83.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.92 
 
 
552 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.96 
 
 
346 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.97 
 
 
245 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.38 
 
 
208 aa  82  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.84 
 
 
316 aa  82  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.79 
 
 
343 aa  80.9  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  29.31 
 
 
331 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.64 
 
 
271 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  29.14 
 
 
331 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.53 
 
 
685 aa  80.9  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.36 
 
 
231 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  29.31 
 
 
331 aa  80.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.01 
 
 
261 aa  80.1  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.95 
 
 
425 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.72 
 
 
218 aa  79.7  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.54 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.17 
 
 
2413 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.36 
 
 
225 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.38 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.39 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
181 aa  77.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
252 aa  76.6  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 
163 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  30.13 
 
 
303 aa  76.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.79 
 
 
1002 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.21 
 
 
255 aa  76.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  41.54 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  38.03 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.67 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  30.67 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  33.96 
 
 
817 aa  75.1  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.726695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>