233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3232 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  100 
 
 
92 aa  184  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  92.39 
 
 
92 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  76.14 
 
 
98 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  73.86 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  74.12 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  58.43 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  58.62 
 
 
91 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  59.77 
 
 
91 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  54.02 
 
 
101 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  54.65 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  50.57 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  52.75 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  49.44 
 
 
92 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  52.44 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  47 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  60.29 
 
 
68 aa  87  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  46.74 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  46.07 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  51.16 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  47.73 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  44.44 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  44.44 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  43.64 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  49.38 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  45.05 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  50 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  50 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  48.42 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  52.63 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  36 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  42.57 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  47.73 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  46.59 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  44 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  42.7 
 
 
90 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  42.53 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  44.44 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  43.33 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  43.02 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39406  predicted protein  38.71 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  41.38 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  49.33 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  45.12 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  45.12 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  51.39 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  50.67 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  44.05 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  43.75 
 
 
101 aa  67  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  49.33 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  47.37 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  39.77 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  47.37 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  37.36 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  43.75 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  39.77 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  43.68 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  37.93 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  48 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  38.64 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  46.99 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  47.5 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  37.93 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  43.9 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  43.53 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  42.86 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  39.02 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  45.78 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  46.99 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  45.78 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2339  BolA/YrbA family protein  45.78 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  45.78 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1207  BolA-like protein  45.78 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3371  BolA-like protein  45.78 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  40.23 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1921  BolA family protein  45.24 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066107  normal  0.787426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  45.78 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  45.78 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  33.33 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  45.78 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  46.99 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  43.66 
 
 
94 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1899  BolA family protein  45.78 
 
 
102 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  36.05 
 
 
127 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  41.57 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  35.63 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1829  BolA family protein  45.78 
 
 
102 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367747  normal  0.761747 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  36.05 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  36.36 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  35.63 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  38.96 
 
 
192 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  37.5 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  36.36 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  36.36 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  34.88 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  33.33 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  42.5 
 
 
96 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2279  putative stress-induced morphogene BolA- like protein  44.05 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  37.5 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>