245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3198 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  96.81 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  82.45 
 
 		 187 aa  315  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  81.91 
 
 		 187 aa  296  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  82.45 
 
 		 188 aa  296  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  67.54 
 
 		 189 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  66.14 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  64.36 
 
 		 186 aa  260  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  64.55 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  63.68 
 
 		 188 aa  257  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  64.74 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  63.3 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  64.06 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  65.1 
 
 		 190 aa  250  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  65.1 
 
 		 190 aa  250  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  65.97 
 
 		 189 aa  249  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  61.98 
 
 		 192 aa  246  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  64.64 
 
 		 190 aa  244  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  65.36 
 
 		 188 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  60.32 
 
 		 187 aa  241  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  64.25 
 
 		 188 aa  237  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  65 
 
 		 188 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  62.3 
 
 		 191 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  57.98 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  58.51 
 
 		 187 aa  225  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  63.49 
 
 		 187 aa  221  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  59.57 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  57.67 
 
 		 192 aa  217  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  59.57 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  56.38 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  58.42 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  57.67 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  57.14 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  59.04 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  58.51 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  54.45 
 
 		 190 aa  210  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  53.72 
 
 		 189 aa  201  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  55.73 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  51.31 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  53.4 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  53.4 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  45.6 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  43.75 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  44.9 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  43.35 
 
 		 326 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  44.74 
 
 		 309 aa  156  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  38.22 
 
 		 254 aa  151  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  42.56 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.95 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  38.74 
 
 		 191 aa  137  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.5 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  36.98 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.63 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  40.56 
 
 		 299 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  37.57 
 
 		 305 aa  111  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.46 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.62 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  31.75 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  28.72 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 72 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.51 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 80 aa  62  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.98 
 
 		 80 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 74 aa  62  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  45 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 		 73 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  40 
 
 		 74 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 80 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 80 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.9 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.03 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.9 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  37.18 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  34.15 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.34 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  40.32 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  39.34 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.98 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  40.98 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  32.26 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>