More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3192 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  96.82 
 
 		 157 aa  290  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  91.08 
 
 		 157 aa  278  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  84.71 
 
 		 157 aa  260  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  82.8 
 
 		 157 aa  255  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  68.15 
 
 		 157 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  67.52 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  65.61 
 
 		 157 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  65.61 
 
 		 157 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 158 aa  223  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  65.61 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  65.61 
 
 		 157 aa  218  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  64.97 
 
 		 157 aa  216  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  63.92 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  60.65 
 
 		 165 aa  206  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  62.42 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  56.77 
 
 		 158 aa  200  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  56.77 
 
 		 158 aa  200  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  61.01 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  62.42 
 
 		 161 aa  197  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  56.13 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  59.62 
 
 		 158 aa  196  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  60.38 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  61.01 
 
 		 159 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  63.95 
 
 		 152 aa  187  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  58.39 
 
 		 160 aa  186  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  55.7 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 158 aa  177  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  50.63 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 162 aa  167  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  50.65 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  50 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  46.84 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 160 aa  153  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  48.41 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  46.45 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  53.03 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  46.45 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  46 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.37 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46 
 
 		 172 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  47.68 
 
 		 155 aa  140  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  50 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  50 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  47.65 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>