More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3065 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  99.32 
 
 
295 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  93.56 
 
 
295 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  74.92 
 
 
295 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  72.88 
 
 
295 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  72.54 
 
 
295 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  60 
 
 
296 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  59.32 
 
 
295 aa  351  8e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  57.64 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  61.36 
 
 
295 aa  329  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  58.67 
 
 
304 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 
295 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  58.46 
 
 
302 aa  311  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  59.56 
 
 
302 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  59.56 
 
 
302 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  60.34 
 
 
295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  57.82 
 
 
293 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  56.13 
 
 
305 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  57.56 
 
 
304 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 
295 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  53.73 
 
 
304 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  52.04 
 
 
300 aa  285  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  54.98 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  46.67 
 
 
302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  49.14 
 
 
302 aa  261  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  47.75 
 
 
295 aa  254  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  47.62 
 
 
309 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  45.09 
 
 
302 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  42.65 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  43.68 
 
 
308 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  42.09 
 
 
308 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  44.49 
 
 
315 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 
305 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  44.49 
 
 
315 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 
346 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  44 
 
 
296 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
312 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  48.3 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  38.35 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  43.61 
 
 
314 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  44.12 
 
 
315 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  42.39 
 
 
300 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  38.13 
 
 
293 aa  193  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  38.25 
 
 
311 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 
304 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  37.89 
 
 
311 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  43.71 
 
 
316 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  40.29 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 
303 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 
319 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 
330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  34.89 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  43.6 
 
 
332 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  37.89 
 
 
311 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 
323 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 
339 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  39.19 
 
 
328 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
285 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  34.49 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 
331 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 
326 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 
303 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  36.2 
 
 
307 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 
285 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 
328 aa  153  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  38.02 
 
 
308 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 
315 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  33.69 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  36.29 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  39.92 
 
 
325 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  35.9 
 
 
338 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  34.51 
 
 
325 aa  148  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  33.69 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  30.47 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  36.15 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  27.89 
 
 
297 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 
299 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.18 
 
 
302 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  32.37 
 
 
314 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  34.05 
 
 
298 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 
327 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 
312 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.1 
 
 
307 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  33.92 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  32.97 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  32.83 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
292 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 
307 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  31.95 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
290 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>