More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2808 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  99.07 
 
 
216 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  46.41 
 
 
210 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  44.71 
 
 
210 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  47.34 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  47.34 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  47.34 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  47.34 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  47.34 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  47.34 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  47.34 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  41.63 
 
 
213 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  35.58 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  34.8 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  34.11 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  34.11 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  34.45 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  35.38 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  32.87 
 
 
217 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  33.65 
 
 
217 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  33.81 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  30.29 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  32.86 
 
 
218 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  26.54 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  29.95 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5367  hexapaptide repeat-containing transferase  28.85 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  34.6 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  34.78 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  34.06 
 
 
202 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  26.67 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  26.21 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  30.96 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  29.95 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  37.21 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  28.83 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  30.9 
 
 
204 aa  82  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  26.86 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  32.37 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  29.86 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  27.14 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  24.87 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  36.5 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  28.73 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  27.37 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  25.71 
 
 
203 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  24.06 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  30.92 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  27.91 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  30.14 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  28.02 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  32.54 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  30.71 
 
 
269 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  28.84 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  29.24 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  27.96 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  30.05 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  26.47 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  26.95 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  25.47 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  35.41 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  27.78 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  24.62 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  28.47 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  28.71 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  28 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  29.46 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  30.83 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  22.71 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  27.14 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  27.6 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  24.31 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  28.37 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  28.5 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  27.59 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  26.52 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  28.24 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  33.11 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  29.89 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  29.36 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  29.23 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  26.37 
 
 
197 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  26.29 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  24.19 
 
 
227 aa  61.6  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  27.61 
 
 
221 aa  61.6  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.48 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  26.97 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  61.11 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  25.97 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  28.91 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2317  galactoside O-acetyltransferase 3; maltose O- acetyltransferase 3  37.14 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.78 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1398  hexapaptide repeat-containing transferase  60.71 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.453151 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  33.12 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1575  hexapaptide repeat-containing transferase  51.85 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  26.92 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  27.75 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3311  hexapaptide repeat-containing transferase  29.29 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0201996  normal  0.383488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  26.54 
 
 
371 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  54.55 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  23.87 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>