107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2775 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2775  catalase  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  97.54 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  87.02 
 
 		 285 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  70.53 
 
 		 295 aa  427  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  65.85 
 
 		 297 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  65.61 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  65.14 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  62.32 
 
 		 274 aa  362  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  56.55 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  55.28 
 
 		 290 aa  308  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  54.23 
 
 		 290 aa  304  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  51.48 
 
 		 270 aa  271  9e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  49.65 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  50.56 
 
 		 284 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  49.12 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  46.47 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  45.09 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  41.88 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  41.16 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  42.54 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  39.16 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  34.06 
 
 		 321 aa  128  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  34.25 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  29.67 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  30.45 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  34.8 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  31.71 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  30.45 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  30.04 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  30.04 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  30.08 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  30.04 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  34.2 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  31.7 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  35.53 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  32.26 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  32.66 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  32.66 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  32.66 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  31.98 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  32.44 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  32.66 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  32.66 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  31.44 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  29.1 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  32.61 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  34.52 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  32.08 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  32.08 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  34.52 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  34.52 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  30.25 
 
 		 421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  32.08 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  34.47 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  31.62 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  32.35 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  27.18 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  28.42 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  30.05 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  32.04 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  31.86 
 
 		 189 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  31.03 
 
 		 189 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000621736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  29.38 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  32.81 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  29.13 
 
 		 205 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  31.22 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000213334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  31.22 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  31.22 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  31.22 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  31.22 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000889969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  31.22 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  31.22 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  31.22 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  31.22 
 
 		 189 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  30.05 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  30.39 
 
 		 189 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  31.22 
 
 		 189 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000660321  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  30.73 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000123231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  30.28 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  28.91 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  29.08 
 
 		 203 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  27.83 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  28.43 
 
 		 188 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  28.31 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  29.95 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  29.59 
 
 		 190 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  28.43 
 
 		 188 aa  85.5  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  29.59 
 
 		 190 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  26.76 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  27.65 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  26.29 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  26.05 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  24.7 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  26.29 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5292  manganese containing catalase  26.64 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0651334  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  26.96 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  26.9 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  24.71 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  24.56 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>