More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2658 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  100 
 
 
382 aa  759  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  99.74 
 
 
382 aa  758  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  94.5 
 
 
379 aa  639  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  72.19 
 
 
389 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  69.6 
 
 
394 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  68.65 
 
 
386 aa  471  1e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  52.97 
 
 
368 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  53.21 
 
 
385 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  50 
 
 
385 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  50.13 
 
 
383 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  48.96 
 
 
383 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  51.72 
 
 
389 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  48.58 
 
 
389 aa  340  3e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  53.85 
 
 
379 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  48.66 
 
 
382 aa  336  3e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  49.21 
 
 
390 aa  337  3e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  48.07 
 
 
407 aa  298  9e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  45.79 
 
 
398 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  36.96 
 
 
405 aa  246  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  39.22 
 
 
399 aa  244  1e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.2 
 
 
403 aa  244  2e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  38.58 
 
 
376 aa  243  4e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.33 
 
 
367 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.27817e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  40 
 
 
384 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  39.53 
 
 
382 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  38.9 
 
 
360 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  42.77 
 
 
379 aa  234  1e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  40.63 
 
 
383 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  39.94 
 
 
383 aa  232  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  41.79 
 
 
362 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  37.46 
 
 
344 aa  230  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.87 
 
 
395 aa  230  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  36.21 
 
 
394 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  37.74 
 
 
413 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  36.77 
 
 
393 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  36.87 
 
 
393 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  42.46 
 
 
370 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  38.29 
 
 
382 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  37.18 
 
 
387 aa  226  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  36.67 
 
 
393 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  35.2 
 
 
355 aa  220  4e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  36.9 
 
 
394 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  35.13 
 
 
433 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  41.14 
 
 
388 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.99 
 
 
387 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  37.85 
 
 
361 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.64 
 
 
459 aa  217  3e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  3.63385e-10 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  35.82 
 
 
391 aa  214  2e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.87062e-07 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  37.72 
 
 
362 aa  214  2e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.07 
 
 
395 aa  213  3e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  36.84 
 
 
399 aa  212  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  33.76 
 
 
395 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  38.32 
 
 
357 aa  209  9e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  32.64 
 
 
400 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  37.08 
 
 
406 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  35.65 
 
 
435 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  38.06 
 
 
359 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  36.24 
 
 
436 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  32.1 
 
 
447 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.95 
 
 
378 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  32.53 
 
 
460 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  38.83 
 
 
347 aa  203  4e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  5.64548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  37.14 
 
 
397 aa  203  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  1.45898e-09 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  37.14 
 
 
397 aa  203  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  36.76 
 
 
360 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  38.57 
 
 
359 aa  202  1e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  32.38 
 
 
462 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  33.07 
 
 
389 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  32.38 
 
 
462 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  38.51 
 
 
378 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.83 
 
 
420 aa  198  1e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  34.12 
 
 
386 aa  198  1e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  33.33 
 
 
399 aa  197  2e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  30.25 
 
 
503 aa  197  2e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  32.99 
 
 
400 aa  197  2e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  31.64 
 
 
465 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  7.6277e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  33.72 
 
 
464 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.39 
 
 
414 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  6.33953e-12 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  29.78 
 
 
498 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  37.11 
 
 
308 aa  196  4e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  37.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  32.99 
 
 
471 aa  196  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  30.93 
 
 
466 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  3.21559e-05 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  32.8 
 
 
454 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  32.8 
 
 
442 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  32.8 
 
 
449 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  32.8 
 
 
437 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  32.8 
 
 
437 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  32.8 
 
 
437 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  33.43 
 
 
379 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.08673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  34.56 
 
 
418 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  32.53 
 
 
445 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  32.11 
 
 
434 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  32.71 
 
 
389 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  32.53 
 
 
454 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  33.78 
 
 
383 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  33.61 
 
 
381 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  33.61 
 
 
381 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  35.1 
 
 
380 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.57 
 
 
464 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>