More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2644 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 		 347 aa  705    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  95.39 
 
 		 357 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  99.14 
 
 		 357 aa  701    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  83.85 
 
 		 338 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  75.6 
 
 		 333 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  75.16 
 
 		 333 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.79 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  73.1 
 
 		 323 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.25 
 
 		 345 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  71.84 
 
 		 324 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  69.69 
 
 		 327 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  68.34 
 
 		 327 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  68.55 
 
 		 323 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.17 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  69.71 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  68.89 
 
 		 323 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  68.57 
 
 		 323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  71.62 
 
 		 323 aa  441  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  71.28 
 
 		 323 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.25 
 
 		 328 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.11 
 
 		 358 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  63.09 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  65.38 
 
 		 375 aa  408  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  59.12 
 
 		 365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  61.66 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  57.44 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  59.26 
 
 		 369 aa  394  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  57.36 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  56.55 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.82 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  56.16 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  56.29 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  55.14 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  52.26 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  51.61 
 
 		 343 aa  325  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.28 
 
 		 347 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  46.26 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.3 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.61 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  42.57 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  46.62 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.26 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.67 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.78 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  44.59 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.98 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  45.76 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  43.85 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.27 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.07 
 
 		 304 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  46.93 
 
 		 331 aa  252  8.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  47.62 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  46.1 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  47.62 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  43.52 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  45.42 
 
 		 302 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.88 
 
 		 306 aa  249  7e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  47.62 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  44.33 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  43.39 
 
 		 306 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.27 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  44.52 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.85 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  43.18 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  44.19 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  43.23 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  41.06 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.9 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  41.53 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  45.34 
 
 		 332 aa  242  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  43.2 
 
 		 304 aa  242  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  46.36 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.86 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.38 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  41.88 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  42.28 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  44.14 
 
 		 337 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  44.14 
 
 		 337 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.58 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  44.14 
 
 		 337 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  43.33 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  43.33 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  41.61 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.61 
 
 		 348 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  43.19 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  46.58 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  44.84 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.24 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  42.19 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.47 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  40 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  42.81 
 
 		 323 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  39.74 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.58 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  42.67 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  41.16 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.12 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  37.8 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.28 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2353  quinolinate synthetase  44.41 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>