More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2568 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  99.29 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  92.91 
 
 		 282 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  74.29 
 
 		 281 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  70.36 
 
 		 280 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  69.29 
 
 		 280 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.9 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  51.06 
 
 		 286 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  56.52 
 
 		 291 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.85 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  52.61 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  53.85 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  53.11 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  54.12 
 
 		 281 aa  285  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  51.27 
 
 		 287 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.17 
 
 		 287 aa  278  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  49.28 
 
 		 284 aa  275  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  49.28 
 
 		 284 aa  274  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  49.64 
 
 		 477 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.75 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  48.39 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.64 
 
 		 286 aa  265  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  47.33 
 
 		 283 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  46.98 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  47.33 
 
 		 289 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  48.58 
 
 		 286 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.59 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.68 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  47.84 
 
 		 288 aa  242  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.94 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.76 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  46.4 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.48 
 
 		 285 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.52 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.52 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  41.34 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.34 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.52 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.34 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.94 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.52 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  45.52 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.16 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.16 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.16 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.59 
 
 		 289 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.61 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  46.55 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.26 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.26 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.07 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.71 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.76 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.26 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.26 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  46.93 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  46.07 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.48 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 		 281 aa  224  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  45.52 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.39 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  43.84 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.44 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  43.21 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  38.99 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  40.15 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  38.66 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  40.59 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  38.97 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  34.06 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.46 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  41.1 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  38.21 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  40.59 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  40.56 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.09 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.91 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  31.77 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  34.28 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.57 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.54 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  37.28 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  41.81 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  37.73 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  40.36 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.33 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  35.14 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>