More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2510 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  98.84 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  91.12 
 
 
259 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  76.56 
 
 
258 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.41 
 
 
255 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  73.23 
 
 
255 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
256 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.17 
 
 
282 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.82 
 
 
255 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.63 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  45.45 
 
 
255 aa  241  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.21 
 
 
256 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.43 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.02 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  44.71 
 
 
256 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  47.83 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.83 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  46.43 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
256 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  46.46 
 
 
255 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.22 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.09 
 
 
256 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.13 
 
 
260 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.84 
 
 
256 aa  218  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.58 
 
 
257 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.66 
 
 
254 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  42.29 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.29 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.62 
 
 
258 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.54 
 
 
259 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
248 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.9 
 
 
278 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.71 
 
 
255 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  40.32 
 
 
255 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.25 
 
 
259 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.31 
 
 
259 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.84 
 
 
258 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.05 
 
 
248 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.46 
 
 
259 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.11 
 
 
256 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  39.77 
 
 
259 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  39.67 
 
 
256 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  38.34 
 
 
262 aa  182  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  42.41 
 
 
255 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.72 
 
 
242 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.07 
 
 
272 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.87 
 
 
258 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.37 
 
 
252 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.08 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.36 
 
 
242 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  38.19 
 
 
252 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.19 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
263 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.69 
 
 
271 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.69 
 
 
257 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.55 
 
 
256 aa  169  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.15 
 
 
255 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.8 
 
 
256 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.61 
 
 
250 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.98 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.05 
 
 
257 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.65 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  39.65 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.35 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.6 
 
 
257 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  39.6 
 
 
257 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.08 
 
 
269 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  40.98 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.17 
 
 
250 aa  161  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  42.17 
 
 
250 aa  161  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.88 
 
 
258 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 
263 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  37.15 
 
 
252 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.19 
 
 
245 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.65 
 
 
259 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.88 
 
 
259 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.64 
 
 
251 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  36.25 
 
 
257 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.09 
 
 
240 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  38.22 
 
 
267 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.91 
 
 
263 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.66 
 
 
257 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.66 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.13 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.2 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.87 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.75 
 
 
267 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.03 
 
 
259 aa  154  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.88 
 
 
257 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.89 
 
 
257 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.56 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.14 
 
 
258 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.86 
 
 
256 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  38 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>