60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2499 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  100 
 
 		 242 aa  480  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  92.68 
 
 		 246 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  83.71 
 
 		 250 aa  358  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  71.35 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  63.51 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  67.21 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  43.05 
 
 		 221 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  38.5 
 
 		 219 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  37.37 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.63 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  38.74 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  37.78 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  33.33 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  38.42 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  33.65 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  37.11 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  35.24 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  37.21 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  37.21 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  33.67 
 
 		 204 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  36.31 
 
 		 211 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  32.87 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  30.39 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  34.84 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  30.13 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  30.13 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  35.03 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  32.43 
 
 		 196 aa  72  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  32.05 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  30.23 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  30.71 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  26.55 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  27.81 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  31.88 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  31.37 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  28.93 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  25.3 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  27.1 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  27.56 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  27.85 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  26.45 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.11 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  28.57 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  29.45 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.45 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  22.77 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  36.45 
 
 		 362 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  24.66 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  31.29 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.75 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  25.61 
 
 		 169 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  25.48 
 
 		 144 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 162 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.32 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  30 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  32.43 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  28.66 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  26.54 
 
 		 179 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  26.7 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>