156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2423 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  67.16 
 
 		 537 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  100 
 
 		 537 aa  1088    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  35.61 
 
 		 860 aa  220  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  33.51 
 
 		 1119 aa  209  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 535 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 956 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 994 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 902 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 703 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.4 
 
 		 700 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 1340 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 1106 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  29.23 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 443 aa  128  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 892 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  29.07 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  30.19 
 
 		 1837 aa  106  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  26.25 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 389 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 		 429 aa  94.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 824 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  29.58 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 		 691 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  30.99 
 
 		 402 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  25.43 
 
 		 419 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 		 1156 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  28.38 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 691 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 691 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 414 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  23.79 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  29.11 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 1152 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  28.45 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 376 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  25 
 
 		 396 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  25.88 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.38 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 406 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  30.77 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 1075 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  31.25 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 995 aa  67.4  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  27.15 
 
 		 399 aa  67  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 388 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  34.04 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 1348 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4707  putative membrane-anchored protein  33.33 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  40 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.9 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  34.13 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1449 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  29.75 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  26.67 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  27.1 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3431  putative membrane-anchored protein  37.31 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 		 958 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  37.14 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  28.97 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.16 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>