More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2346 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  99.89 
 
 
874 aa  1747  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0502533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  59.81 
 
 
857 aa  1009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3145  ATP-dependent chaperone ClpB  59.84 
 
 
861 aa  993  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  80.26 
 
 
879 aa  1356  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  57.78 
 
 
889 aa  977  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1996  ATP-dependent chaperone ClpB  54.34 
 
 
866 aa  914  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  98.6 
 
 
874 aa  1704  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  98.86 
 
 
874 aa  1731  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02158  ATP-dependent chaperone ClpB  59.21 
 
 
898 aa  981  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.46606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1210  ATP-dependent chaperone ClpB  58.8 
 
 
862 aa  973  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890836  normal  0.0751244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  57.43 
 
 
865 aa  976  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  58.97 
 
 
857 aa  1004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.39096e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0836  ATP-dependent chaperone ClpB  56.46 
 
 
860 aa  936  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00212148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  56.84 
 
 
865 aa  963  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  78.75 
 
 
865 aa  1369  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1779  ATP-dependent chaperone ClpB  58.71 
 
 
861 aa  985  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.772911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  55.84 
 
 
872 aa  937  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  59.81 
 
 
857 aa  1010  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  59.81 
 
 
857 aa  1009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  57.58 
 
 
824 aa  946  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  55.48 
 
 
890 aa  922  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  55.41 
 
 
872 aa  957  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1223  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.28 
 
 
866 aa  919  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  79.88 
 
 
864 aa  1358  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3270  ATP-dependent chaperone ClpB  56.48 
 
 
857 aa  952  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.97344e-05  normal  0.063711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  57.98 
 
 
860 aa  961  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.05 
 
 
866 aa  912  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  75.15 
 
 
866 aa  1278  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  70.12 
 
 
867 aa  1217  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  58.97 
 
 
857 aa  1005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.68048e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0666  chaperone ClpB (heat-shock protein)  57.04 
 
 
861 aa  967  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00205546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  58.22 
 
 
866 aa  974  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  9.23416e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  59.81 
 
 
857 aa  1009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  59.81 
 
 
857 aa  1009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.79848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  58.24 
 
 
864 aa  989  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  60.44 
 
 
870 aa  983  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1757  ATP-dependent chaperone ClpB  56.3 
 
 
865 aa  965  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786862  normal  0.0714253 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0453  ATP-dependent chaperone ClpB  56.57 
 
 
867 aa  943  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.17348e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2019  ATP-dependent chaperone ClpB  58.26 
 
 
865 aa  974  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1121  ATPase AAA-2 domain protein  56.48 
 
 
857 aa  952  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0611865  normal  0.087173 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  51.34 
 
 
863 aa  921  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  59.2 
 
 
859 aa  1007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0120  ATPase  56.93 
 
 
863 aa  922  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  6.37349e-05 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  71.77 
 
 
871 aa  1244  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  59.07 
 
 
862 aa  999  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0229  ATPase  58.27 
 
 
870 aa  954  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  56.34 
 
 
857 aa  958  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0886  protein disaggregation chaperone  58.38 
 
 
857 aa  976  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.76912e-05  normal  0.0332416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3497  ATPase  56.19 
 
 
857 aa  949  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.648443  normal  0.0100947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2878  protein disaggregation chaperone  58.97 
 
 
857 aa  1005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000852772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2750  protein disaggregation chaperone  58.97 
 
 
857 aa  1005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.17665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01007  hypothetical protein  57.13 
 
 
857 aa  959  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  58.65 
 
 
871 aa  1006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  57.38 
 
 
859 aa  962  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  79.03 
 
 
879 aa  1365  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  55.39 
 
 
861 aa  933  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  57.58 
 
 
870 aa  960  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1426  ATP-dependent chaperone ClpB  57.13 
 
 
865 aa  969  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814742  hitchhiker  0.00462707 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1850  ATP-dependent Clp protease subunit  58.82 
 
 
861 aa  989  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.808048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  89.41 
 
 
878 aa  1576  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1871  ATP-dependent chaperone ClpB  56.89 
 
 
865 aa  967  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  hitchhiker  0.00068735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3720  ATP-dependent chaperone ClpB  56.47 
 
 
857 aa  961  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00907871  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  93.04 
 
 
874 aa  1631  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  57.28 
 
 
854 aa  973  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  58.97 
 
 
857 aa  1005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  58.97 
 
 
857 aa  1005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.60565e-06  decreased coverage  6.35783e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3349  protein disaggregation chaperone  58.67 
 
 
857 aa  988  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.33942e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  57.73 
 
 
862 aa  922  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  71.05 
 
 
864 aa  1210  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0671  ATP-dependent chaperone ClpB  57.28 
 
 
854 aa  952  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1077  ATPase  53.82 
 
 
866 aa  913  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  100 
 
 
874 aa  1748  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3475  protein disaggregation chaperone  58.67 
 
 
857 aa  988  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000223362  normal  0.392358 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  57.49 
 
 
859 aa  963  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  75.35 
 
 
880 aa  1302  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  56.49 
 
 
872 aa  980  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  55.15 
 
 
871 aa  927  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.52857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1381  ATP-dependent chaperone ClpB  52.18 
 
 
857 aa  906  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  3.10398e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0234  ATP-dependent chaperone ClpB  59.46 
 
 
863 aa  962  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  56.29 
 
 
880 aa  952  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  57.72 
 
 
857 aa  963  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4437  ATP-dependent chaperone ClpB  56.16 
 
 
876 aa  945  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4102  ATP-dependent chaperone ClpB  59.57 
 
 
850 aa  965  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5924  ATP-dependent chaperone ClpB  57.67 
 
 
880 aa  937  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  56.96 
 
 
860 aa  967  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1138  protein disaggregation chaperone  58.1 
 
 
858 aa  978  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5193  ATP-dependent chaperone ClpB  59.93 
 
 
874 aa  992  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  55.96 
 
 
866 aa  959  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.17935e-08  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  54.16 
 
 
863 aa  918  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3068  ATP-dependent chaperone ClpB  55.94 
 
 
887 aa  937  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0100  ATP-dependent chaperone ClpB  56.68 
 
 
860 aa  932  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.373648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2431  ATP-dependent chaperone ClpB  54.88 
 
 
865 aa  912  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.500769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  59.18 
 
 
867 aa  991  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3161  ATP-dependent chaperone ClpB  56.68 
 
 
871 aa  912  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0525  ATPase AAA-2  57.93 
 
 
860 aa  956  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  53.11 
 
 
894 aa  905  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  58.16 
 
 
855 aa  960  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5467  ATP-dependent chaperone ClpB  58.13 
 
 
871 aa  956  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.184424  normal  0.486747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  59.62 
 
 
861 aa  969  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0494  ATP-dependent chaperone ClpB  58.21 
 
 
846 aa  976  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>