More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2325 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
938 aa  711    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
938 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
938 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
924 aa  792    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
923 aa  782    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
943 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
916 aa  659    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
939 aa  691    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0967  isoleucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
945 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
921 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  40 
 
 
953 aa  685    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2109  isoleucyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
945 aa  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
931 aa  723    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 
972 aa  1170    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
940 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
943 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
921 aa  707    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
921 aa  711    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
945 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
921 aa  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
945 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
940 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
931 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
931 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
959 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
943 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
941 aa  672    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
932 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
946 aa  668    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
974 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
940 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
929 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 
999 aa  1324    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
978 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
945 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1033  isoleucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
945 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
940 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
943 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 
984 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
927 aa  739    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
945 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
960 aa  643    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2112  isoleucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
945 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
923 aa  784    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
934 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
943 aa  656    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
921 aa  707    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
919 aa  640    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
984 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
954 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
943 aa  714    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
951 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 
940 aa  1049    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
930 aa  725    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
945 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
946 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  62.58 
 
 
1054 aa  1303    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
968 aa  880    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
944 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
992 aa  1058    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
975 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
932 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 
1024 aa  1319    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
934 aa  661    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3849  isoleucyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
943 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471166  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
945 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
943 aa  700    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 
987 aa  1086    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  64.57 
 
 
1001 aa  1305    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
946 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  65.75 
 
 
999 aa  1327    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
947 aa  678    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
959 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
938 aa  675    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
936 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
974 aa  1064    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
1063 aa  860    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
945 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
942 aa  707    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
985 aa  1167    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
937 aa  694    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
1152 aa  658    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
940 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
940 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
941 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
943 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
927 aa  724    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
990 aa  1055    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
945 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
943 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0971  isoleucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
945 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.581767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
944 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
940 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  58.36 
 
 
971 aa  1147    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  44 
 
 
941 aa  717    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
945 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
939 aa  677    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
928 aa  786    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
954 aa  813    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
940 aa  693    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>