51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2299 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  98.99 
 
 		 198 aa  393  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  92.42 
 
 		 198 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  74.82 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  70.59 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  69.78 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  46.32 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  39.74 
 
 		 191 aa  121  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  39.57 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  30.94 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  30.94 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  28.26 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  26.15 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  30.93 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  30.93 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  30.93 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  26.28 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  29.03 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  29.03 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  29.46 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  28.68 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  23.02 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  31.82 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  38.64 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  26.26 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  38.64 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  25.77 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  38.64 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  38.64 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  38.64 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  38.64 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  38.64 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  38.64 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  26.26 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  38.64 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  25.33 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  38.64 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  38.64 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  32.69 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  27.38 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  26.67 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  25.55 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  30.3 
 
 		 158 aa  41.6  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>