More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2225 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  93.38 
 
 		 424 aa  797    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  98.35 
 
 		 423 aa  842    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 423 aa  855    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  74.64 
 
 		 421 aa  597  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  64.37 
 
 		 424 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  64.52 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  42.79 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  42.78 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  42.13 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  42.53 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  40.39 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  31.19 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.65 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 404 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 403 aa  100  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  25.54 
 
 		 401 aa  90.1  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 374 aa  87  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  23.52 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.51 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1125  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6490  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.51 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  22.29 
 
 		 778 aa  80.1  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  29.91 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  39.49 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.6 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  36.42 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 733 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  23.51 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  29.22 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 		 812 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  37.82 
 
 		 803 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  34.27 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  43.59 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 782 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  27.86 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 904 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  34.4 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 		 704 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 		 816 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>