More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2224 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
434 aa  848  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  96.54 
 
 
434 aa  751  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  84.49 
 
 
443 aa  644  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  62.75 
 
 
422 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  67.99 
 
 
420 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  64.19 
 
 
421 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  42.79 
 
 
423 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  41.9 
 
 
424 aa  249  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  41.9 
 
 
423 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
424 aa  240  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  42.16 
 
 
421 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 
422 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
410 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
448 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
431 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
448 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  26.7 
 
 
401 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
403 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
403 aa  115  1e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
404 aa  113  7e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
414 aa  113  8e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
415 aa  111  2e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
392 aa  109  8e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
401 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
445 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
405 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
415 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
414 aa  96.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
410 aa  96.3  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  27.88 
 
 
384 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 
404 aa  90.1  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
403 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  28.12 
 
 
403 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
391 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
390 aa  84  5e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
409 aa  83.6  6e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
387 aa  82.8  1e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  31.72 
 
 
401 aa  79.3  1e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
384 aa  77  6e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
414 aa  75.1  2e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
364 aa  75.1  2e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
391 aa  75.5  2e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  22.93 
 
 
778 aa  74.3  4e-12  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 
356 aa  73.2  8e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
352 aa  72.4  1e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
397 aa  72  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2824  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
352 aa  72.4  2e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0922  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
365 aa  72  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
394 aa  71.2  3e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
904 aa  70.9  4e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
392 aa  70.1  8e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
346 aa  70.1  8e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
358 aa  68.9  1e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
413 aa  67.8  4e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
405 aa  67.8  4e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
454 aa  67.4  4e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
364 aa  67.4  5e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  2.26756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  33.54 
 
 
371 aa  65.9  1e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  27.27 
 
 
679 aa  65.9  1e-09  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
418 aa  65.9  1e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  38.46 
 
 
360 aa  64.7  3e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.13 
 
 
536 aa  64.7  3e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
402 aa  64.3  4e-09  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  1.45174e-05 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0479  putative glycosyltransferase  31.55 
 
 
366 aa  64.3  4e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
445 aa  63.9  5e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
374 aa  63.9  5e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  36.65 
 
 
340 aa  63.5  6e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
373 aa  63.5  6e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
358 aa  63.5  7e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  30.41 
 
 
413 aa  63.2  8e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
387 aa  63.2  9e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
339 aa  62.8  1e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
398 aa  62.8  1e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1918  UDP-glucose:tetrahydrobiopterin glucosyltransferase  34.59 
 
 
359 aa  62.4  1e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.4 
 
 
397 aa  62  2e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
374 aa  62  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
435 aa  62  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.72843e-05 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.93 
 
 
377 aa  61.2  3e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  25.91 
 
 
395 aa  61.6  3e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
353 aa  60.8  4e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0283  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
346 aa  60.8  4e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 
354 aa  60.8  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 
354 aa  60.8  5e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  21.2 
 
 
409 aa  60.8  5e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 
354 aa  60.8  5e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 
354 aa  60.8  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
753 aa  60.5  5e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  28.25 
 
 
354 aa  60.8  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 
354 aa  60.8  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 
354 aa  60.8  5e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
376 aa  60.5  6e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
336 aa  60.5  6e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
462 aa  60.1  7e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3451  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
412 aa  60.1  7e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  36.05 
 
 
361 aa  60.5  7e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
390 aa  60.1  8e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>