More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2177 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  588  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  99.32 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  94.16 
 
 		 293 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  75.43 
 
 		 290 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  47.92 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  46.89 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  46.89 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  47.55 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  46.24 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  46.27 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  47.74 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  44.94 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  43.26 
 
 		 322 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  50.9 
 
 		 238 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  40.86 
 
 		 279 aa  215  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  43.46 
 
 		 339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  42.05 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  43.18 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  42.45 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  41.7 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  41.98 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  40.34 
 
 		 351 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  43.39 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  42.2 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  41.22 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  42.76 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  41.9 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  46.95 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  43.38 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  43.38 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  38.19 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  37.81 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  39.86 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  43.54 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  40.89 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  43.54 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  43.2 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  34.97 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 		 320 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  43.68 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  43.17 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  36.27 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  35.74 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  39.58 
 
 		 324 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 335 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  36.62 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  42.28 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  34.71 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  34.36 
 
 		 330 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  32.07 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  33.45 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  35.23 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  35.25 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.12 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  35.13 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  35.02 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.22 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  32.88 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  32.75 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  31.64 
 
 		 300 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  30.71 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>