More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2171 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 88 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 88 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  97.4 
 
 		 88 aa  157  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  86.05 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  84.71 
 
 		 85 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  88 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  73.75 
 
 		 82 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  72.5 
 
 		 80 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  70.59 
 
 		 81 aa  120  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  65.82 
 
 		 80 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  65 
 
 		 80 aa  113  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  65 
 
 		 80 aa  113  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 78 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 		 82 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 		 82 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 79 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 78 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 79 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 76 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 80 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 80 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 80 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  55.68 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 76 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  56.63 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  57.3 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  61.11 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  61.43 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  68 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 76 aa  90.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  61.36 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  58.57 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  65.33 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  51.85 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  51.9 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  55.56 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  59.42 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  54.41 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  53.62 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  62.12 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  62.12 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  55.56 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>