More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2122 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 726 aa  1456    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  98.76 
 
 		 726 aa  1437    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  63.77 
 
 		 726 aa  884    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  86.78 
 
 		 743 aa  1280    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 815 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 825 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  35.83 
 
 		 825 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 		 860 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 708 aa  353  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.8 
 
 		 708 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 		 850 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 709 aa  338  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  32.91 
 
 		 703 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.99 
 
 		 696 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 734 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 703 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.63 
 
 		 703 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 708 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 732 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.57 
 
 		 696 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 		 741 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 711 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 862 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 		 843 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 736 aa  324  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 710 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  35.49 
 
 		 859 aa  323  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 		 722 aa  323  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 701 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 710 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.46 
 
 		 709 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.51 
 
 		 711 aa  316  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 730 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 689 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 864 aa  309  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 		 817 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 837 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 692 aa  300  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  34.1 
 
 		 715 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 757 aa  287  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 710 aa  286  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 722 aa  283  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 821 aa  281  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 726 aa  277  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  31.15 
 
 		 799 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 701 aa  271  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  33.52 
 
 		 801 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 700 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 709 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 701 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 701 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 701 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 829 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 792 aa  264  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 707 aa  263  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 689 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 701 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 755 aa  261  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 701 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 701 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 689 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  31.76 
 
 		 689 aa  260  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 698 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 770 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 710 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 799 aa  257  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 710 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 719 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 771 aa  254  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 794 aa  253  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 796 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 747 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  30.52 
 
 		 703 aa  252  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 796 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 796 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.3 
 
 		 706 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 796 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 819 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 733 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 742 aa  248  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 753 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 705 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.19 
 
 		 833 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 694 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 745 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 722 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 721 aa  243  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 829 aa  243  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 707 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.83 
 
 		 713 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 720 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.83 
 
 		 713 aa  241  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.63 
 
 		 713 aa  240  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 715 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 724 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>