116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2041 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  86.02 
 
 		 186 aa  323  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  57.45 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  62.03 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  56.38 
 
 		 188 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  56.38 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  55.91 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  51.09 
 
 		 188 aa  177  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  35.58 
 
 		 234 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  34.41 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  37.28 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  30.86 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  32.39 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  32.08 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  32.92 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  29.78 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  32.7 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  33.94 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  35 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  33.96 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  30.68 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  30.41 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  31.9 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0614  hypothetical protein  30.16 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  28.92 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  35.26 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  39.45 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  32.56 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  34.39 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4289  hypothetical protein  31.89 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  34.59 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  25.85 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  33.57 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  31.48 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  27.91 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  29.65 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  29.65 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  37.27 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  32.8 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  33.11 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  31.48 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  29.8 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  29.17 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  35.78 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  28.46 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  26.01 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  29.93 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  31.73 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  29.93 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  29.93 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  30.91 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  32.14 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  32.82 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  31.35 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  34.35 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  25.6 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  24 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  31.94 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  27.57 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  25.6 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  24 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  31.94 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4350  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  30.46 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  28.65 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  31.11 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  30.56 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  29.55 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  23.42 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  25.45 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  29.69 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  24.59 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  30.71 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  23.81 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  27.54 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  25.99 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  28.7 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  29.21 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.13 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  30.08 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  33.03 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  29.91 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>