More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2014 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 378 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  98.41 
 
 		 378 aa  736    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  86.77 
 
 		 373 aa  607  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  60.83 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  40.74 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  38.64 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  34.48 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  32.78 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  31.11 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  29.55 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 		 354 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  37.05 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.57 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  30.5 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.82 
 
 		 278 aa  99.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  28.53 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.25 
 
 		 264 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.03 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  30.52 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  27.84 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  32.27 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.09 
 
 		 504 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  32.63 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.92 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  35.19 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  36.46 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  34.74 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.87 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.97 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  28.99 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.7 
 
 		 494 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  35.93 
 
 		 533 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  33.53 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  33.53 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  29.24 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  31.25 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  24.26 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  24.36 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  24.36 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  28.22 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  29.19 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  27.72 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  19.49 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  27.53 
 
 		 289 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  31.31 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  28.04 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  27.23 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  29.46 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.67 
 
 		 573 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.12 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  27.55 
 
 		 604 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  29.46 
 
 		 436 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 541 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  31.49 
 
 		 514 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  22.75 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.27 
 
 		 605 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  30.27 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  28.88 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.9 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.32 
 
 		 475 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  27.01 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  31.01 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  31.01 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  31.09 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  26.5 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  30.22 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  26.5 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  38.28 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  32.65 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  30.92 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2649  putative Zn-dependent protease  32.48 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  26.79 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  28.09 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>