22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1992 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  362  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  98.37 
 
 		 184 aa  356  9e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  89.13 
 
 		 184 aa  313  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6011  hypothetical protein  54.13 
 
 		 133 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.83036  normal  0.0239799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  34.65 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  31.9 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  25.27 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  26.57 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  31.86 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  34.62 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  29.52 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  32.35 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  30.88 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  27.01 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  41.86 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  31.88 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  26.96 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  35.09 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  34.62 
 
 		 178 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  32.56 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  27.94 
 
 		 203 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>