More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1908 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  100 
 
 
120 aa  238  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  80.67 
 
 
119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  84.75 
 
 
118 aa  183  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  83.19 
 
 
119 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  71.67 
 
 
120 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  73.11 
 
 
119 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  75.63 
 
 
119 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  73.95 
 
 
119 aa  168  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  73.11 
 
 
119 aa  153  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  61.54 
 
 
119 aa  146  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  65.45 
 
 
120 aa  140  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  64.81 
 
 
113 aa  140  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  59.17 
 
 
120 aa  137  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  60.33 
 
 
120 aa  135  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  68.38 
 
 
119 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  57.02 
 
 
123 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  65.25 
 
 
119 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  57.8 
 
 
118 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  58.41 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  58.88 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  57.89 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  59.41 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  59.41 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  56.36 
 
 
130 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  55.1 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 
114 aa  110  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  51.3 
 
 
123 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  49.57 
 
 
118 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3211  regulatory protein ArsR  55.86 
 
 
121 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
109 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  49.55 
 
 
113 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  47.41 
 
 
124 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
111 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  48.65 
 
 
110 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  47.71 
 
 
111 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
117 aa  100  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
113 aa  100  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
109 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  47.75 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 
109 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
111 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
111 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
155 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  60 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  46.85 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
115 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
111 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  47.06 
 
 
111 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  47.75 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
158 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
291 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  45.37 
 
 
123 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  45.37 
 
 
111 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
107 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
106 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 
110 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  45.37 
 
 
244 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
227 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
109 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
110 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  50.56 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
117 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
111 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  43.56 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  43.93 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
112 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
108 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  45.26 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  48.86 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  52.33 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  42.02 
 
 
298 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>