More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1860 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  94.39 
 
 		 107 aa  204  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  87.85 
 
 		 107 aa  190  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  79.44 
 
 		 107 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  75.7 
 
 		 107 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  65.71 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  59.81 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  59.81 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  57.94 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  57.94 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  57.94 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  56.07 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  62.5 
 
 		 108 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  62.5 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  62.5 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  59.05 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  59.05 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  60.58 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  60.58 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  57.69 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  58.82 
 
 		 108 aa  116  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  63.83 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  55.67 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  57.69 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  59.8 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  54.21 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  58.65 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  63.83 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  54.21 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  58.65 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  58.65 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  58.65 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  59.22 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  57.43 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  55.77 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0620  hypothetical protein  61.7 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.961902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  56.44 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  56.44 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  58.65 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  53.27 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  54.21 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  56.44 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  57.84 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  54.29 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  57.84 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  54.29 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  57.84 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  52.34 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  58.42 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  55.45 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  56.44 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  53.33 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  56.73 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  56.19 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  56.19 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  56.44 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  57.43 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  56.86 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  56.86 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  57.84 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  56.48 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  55.88 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  57.41 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0667  hypothetical protein  60.64 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  57.41 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  56.44 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  57.84 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  56.44 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  56.44 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  57.14 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  51.43 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  55.88 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  46.73 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  51.49 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  55.24 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  51 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  55.24 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  53.92 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0086  hypothetical protein  59.57 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.643504  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  55.1 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  54.29 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  53.92 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  55.45 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>