281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1858 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  100 
 
 
192 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  100 
 
 
192 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  98.96 
 
 
192 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  86.98 
 
 
195 aa  337  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  75.79 
 
 
190 aa  293  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  74.21 
 
 
190 aa  287  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  47.96 
 
 
196 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  44.98 
 
 
219 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  46.19 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  47.06 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  53.33 
 
 
234 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  56.67 
 
 
238 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  52.67 
 
 
235 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  52.03 
 
 
247 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  52 
 
 
235 aa  161  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  54 
 
 
187 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  51.33 
 
 
195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  51.33 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  48 
 
 
196 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  49.33 
 
 
186 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  48 
 
 
191 aa  140  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  48 
 
 
191 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  47.33 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  48 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  48.67 
 
 
221 aa  131  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  44.67 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  46.75 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  44.81 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  44.81 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  47.02 
 
 
196 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.67 
 
 
193 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  39.47 
 
 
153 aa  111  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  39.6 
 
 
193 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  34.84 
 
 
185 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.91 
 
 
177 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  33.85 
 
 
185 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  37.42 
 
 
178 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  38 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  32.29 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  35.95 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  32.67 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  34.87 
 
 
184 aa  91.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  33.75 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  30.92 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  40.74 
 
 
419 aa  89  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  34.21 
 
 
177 aa  89  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  41.35 
 
 
439 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  41.35 
 
 
455 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  34.87 
 
 
177 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  41.35 
 
 
455 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  40.94 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  35 
 
 
427 aa  78.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  38.17 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  35.92 
 
 
270 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  37.88 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  33.56 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  31.76 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  42.73 
 
 
816 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  34.75 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  32.26 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  30.23 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.93 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  32.77 
 
 
459 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  31.65 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  30.94 
 
 
249 aa  68.2  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  33.75 
 
 
410 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  31.55 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  32 
 
 
257 aa  67.8  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  35.77 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  31.14 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  31.74 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  33.58 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  29.17 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  30.3 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  33.82 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  29.9 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  29.88 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.49 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  29.48 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  32.74 
 
 
268 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  33.12 
 
 
441 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  34.48 
 
 
417 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  32.8 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.06 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  33.93 
 
 
415 aa  62.8  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  33.87 
 
 
478 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  33.93 
 
 
415 aa  63.2  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  34.31 
 
 
452 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  29.69 
 
 
435 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  32.02 
 
 
372 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  33.04 
 
 
415 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  29.9 
 
 
379 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.31 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  32.77 
 
 
423 aa  62  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  34.85 
 
 
264 aa  62  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
461 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  28.02 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  33.55 
 
 
391 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  32.35 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>