23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1845 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  98.87 
 
 
177 aa  350  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  88.12 
 
 
177 aa  288  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  57.3 
 
 
175 aa  201  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  53.85 
 
 
174 aa  174  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  51.05 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  39.44 
 
 
191 aa  84.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  32.1 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  33.54 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  31.55 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  31.72 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  31.68 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  33.06 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  30.19 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  31.06 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  32.63 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  30.99 
 
 
161 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  32.63 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  26.96 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  28.21 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6073  hypothetical protein  25.9 
 
 
314 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  28.32 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  27.88 
 
 
198 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>