214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1813 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  95.38 
 
 
130 aa  243  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  95.83 
 
 
126 aa  224  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  70.83 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  65.83 
 
 
125 aa  155  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5757  dihydroneopterin aldolase  68.25 
 
 
126 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  42.15 
 
 
131 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  45.83 
 
 
276 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  45 
 
 
122 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  46.67 
 
 
121 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  40.48 
 
 
292 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  38.66 
 
 
120 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
120 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 
121 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  38.84 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  38.79 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  40.83 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  35.83 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  43.7 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  42.37 
 
 
145 aa  93.2  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  43.59 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
119 aa  92  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  38.71 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  48.31 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
130 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  38.02 
 
 
121 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  38.66 
 
 
125 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  38.02 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  41.12 
 
 
119 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  42.02 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
121 aa  87  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  41.6 
 
 
337 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  41.32 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1277  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  38.33 
 
 
273 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00023315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1099  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  38.33 
 
 
273 aa  85.5  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00662254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  45.13 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  38.05 
 
 
119 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  38.05 
 
 
119 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  35.83 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  39.34 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  39.5 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  44.63 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  43.8 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  44.44 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  44.44 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  33.61 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  39.34 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  43.8 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  35.19 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  43.09 
 
 
310 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  41.88 
 
 
333 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  40.57 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  40.68 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  40.83 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  41.46 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  40.52 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  36 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  33.65 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  36.07 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  36.13 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  31.86 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0705  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  40.5 
 
 
372 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  31.73 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  41.51 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.44 
 
 
305 aa  70.1  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  34.31 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  37.5 
 
 
841 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  32.67 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3489  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  37.62 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  31.73 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0642  dihydroneopterin aldolase  37.62 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0062144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3521  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  37.62 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.316969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3351  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  37.62 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732659  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0641  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  37.62 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000115743  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02878  hypothetical protein  37.62 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000977298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>