32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1588 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  95.65 
 
 		 188 aa  322  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  76.02 
 
 		 181 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  67.26 
 
 		 178 aa  228  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  66.67 
 
 		 178 aa  224  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  47.73 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  38.46 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  33.96 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  35.9 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  32.22 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  33.54 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  32.69 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  33.15 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  30.6 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  31.41 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  34.09 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  34.09 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  32.37 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  32.8 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  32.47 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  28.74 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  28.74 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  29.63 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  29.63 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  28.1 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  26.97 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  31.97 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  27.38 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>