64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1479 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
136 aa  266  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0471867  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  93.38 
 
 
136 aa  245  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.73273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  81.62 
 
 
136 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398514  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  40.77 
 
 
131 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1419  putative acetyltransferase  44.44 
 
 
139 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.227505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.404127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  41.73 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  38.58 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1517  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0094  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.313389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3125  GCN5-related N-acetyltransferase  37.19 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.636265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4442  GCN5-related N-acetyltransferase  42.75 
 
 
134 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2830  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242338  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  40.34 
 
 
133 aa  84  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0108675  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1759  GCN5-related N-acetyltransferase  46.07 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.200075  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0079  hypothetical protein  38.14 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2483  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0079  hypothetical protein  39.18 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.668826  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171947  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3498  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91187  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2240  hypothetical protein  28.7 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0216182  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000434676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1924  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1637  acetyltransferase  41.38 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.240715  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3134  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703967  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17681  GNAT family acetyltransferase  27.73 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3143  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
143 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.249751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3488  hypothetical protein  25.29 
 
 
140 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0164567  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1922  acetyltransferase  31.11 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1348  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1733  GNAT family acetyltransferase  22.48 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.804122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5770  hypothetical protein  36.36 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1448  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0935976  normal  0.790583 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18501  GNAT family acetyltransferase  25 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2848  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08300  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.58 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3418  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259832  hitchhiker  0.00983825 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18311  GNAT family acetyltransferase  24.35 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.662175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5884  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.810647  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00911  putative acetyltransferase, GNAT family  34.38 
 
 
160 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0344601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1392  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182115  normal  0.0388406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  38.33 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05930  acetyltransferase (GNAT) family protein  45.45 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.415586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1906  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537884  hitchhiker  0.0000285957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4121  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3046  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1231  putative acetyltransferase, GNAT family  25 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4973  GCN5-like N-acetyltransferase  33.8 
 
 
175 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000872655  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0773  hypothetical protein  30.77 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208077  normal  0.373974 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43627  predicted protein  27.59 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18291  GNAT family acetyltransferase  23 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01210  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.82 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3028  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
175 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
175 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.42411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0993  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
162 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0565892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>